Cool Edit Pro, Nero, creo que tambien musicmatch jukebox... son los unicos que me vienen a la mente, pero todos ellos son de pago.
¿Porque deseas cambiar MP3 a MP3Pro? Ese formato esta mas muerto que el wma, aparte de que al pasar de MP3 a MP3Pro hara que pierdas mucha calidad, lo ideal seria que grabaras desde CD-audio, pero aun asi el formato no da para mucho... te recomendaria mejor pasar a OGG que es gratis, pero NUNCA conviertas desde un MP3. Es mi opinion y seguro que la comparto con muchos del foro.
Salu2 y suerte.