Problemas en disco duro

Resulta q de repente, el disco duro q uso de almacen, un seagate de 160 GB en formato fat32, resulta q al arrancar tanto linux como windows, se quedan pillados y tarda muchisimo en arrancar ambos sitemas.
De hecho en linux en el boot detecta q hay errores en en este disco duro (hdd1). No he hecho nada especial con el hd, ha sido de repente al reiniciar cuando ha ocurrido esto.
Le he pasado el scandisk, y me ha dicho q hay un error en la asignacion de la tabla de archivos y q esto impide q se pueda reparar la unidad.

Q puedo hacer para reparar esto? tengo muchas datos y no quisiera perderlos, el hd esta en garantiia. En el peor de los casos mandaria un RMA a seagte y me lo cambiarian, pero espero no tener q llegar a eso.

Espero vuestras respuestas como siempre, muchas gracias. bye

EDITO> Entrando desde knoppix, live cd de linux, no me da problemas el disco duro y puedo acceder a todos los datos. Podria copiar algunas cosas al otro disco duro, pero espero q haya una solucion mas facil sin perder datos.
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