Bueno has dejado muchas cosas en el aire, pero me imagino que usas Windows XP.
Lo primero seria comprobar que nombre les da el Sistema Operativo a ambas grabadoras, para ver si se corresponde con el suyo real.
Que el Nero no te las reconozca, podria ser si es una versión antigua del mismo pero seria muy raro.
Me imagino que la BIOS te reconoce las grabadoras sin problemas, pero este seria el primer punto a mirar.
Después de esto si sigues igual, tal vez lo que te ocurre son caprichos del equipo y se solucione cambiando las grabadoras como master en el IDE secundario.
Tal vez sea, otra cosa. Pero harian falta algunos datos más.
Espero haberte ayudado,
Atentamente,
Newbie