No existe formato MOV, ni formato AVI ni formato MP4 o formato MKV, pero lo que si existe es el contenedor de video MOV, FLV, MPG, AVI, MP4, RMVB, OGM, MKV.
Lo que puede estar pasando es que iTunes este recodificando el video al formato de video propio de Quicktime [qtrpza o el 8bps o el Sorenzon video o en ultimo caso al h.264] para poderlo meter al contenedor propietario MOV de quicktime. O bien iTunes esta metiendo algun seguro o codigo que evita su reproduccion, de preferencia bajalo directamente desde tu software cliente navegador u otro administrador de descargas [flashget, alldwonloader, etc.]
Ahora con FFDSHOW-TRYOUT o FFDS-TO -el a secas "FFDShow" es un proyecto avandonado y desactualizado mientras el FFDS-TO es un proyecto vivo y actualizado- deberia bastar mientras que en "video decoders configuration" habilites todos los formatos de video que quieres puedas ver dese cualquier reproductor que soporte filtros VFW y DirectSHow -windows media, windows media classic-home cinema, KMPlayer, BSPlayer, etc.-, eso mienmtras estes usando windows.
En macos seria mejor opcion programas reproductores para macos que usen sus propios filttros/codecs integrados como VLC que por cierto no requiere instalacion.