A mi me empieza a sonar que puede ser un problema de alimentacion electrica... Que por muy buena que sea la fuente, quiza algo haya podido pasar de ella y haya llegao a la placa. O que por algun rizado en la corriente haya venido una bajada de tension (o pico, quiza) y la placa haya 'decidido' trabajar asi, desconectando usb para protegerse ante la falta de alimentacion.
Si tienes la posibilidad de probar con un SAI, ya salimos de dudas por completo, ya que segun creo si con un SAI, fuente 'nueva', te sigue haciendo lo mismo.... a mi me suena a placa tocada en alguna parte.