Así se me ocurre que puedan ser tres cosas. O bien que tengas el disco duro mal y el explorer se vuelva loco intentando leer todos los archivos erroneamete (no lo creo), que tengas algún complemento que te está disparando el uso de la memoria o que tengas el explorer corrupto.
Lo primero a ver si podemos ver qué es lo que está produciendo el excesivo uso de memoria. En el Process Explorer, pincha en el proceso explorer.exe, pulsa CTRL+D para mostrar las DLLs que carga el proceso (explorer.exe) y en el menú View > Select Columns > Ficha DLL > Activa las casillas: WS Total Bytes, WS Private Bytes, WS Shareable Bytes, WS Shared Bytes. Y comprueba entre las DLLs cual te está comiendo la memoria (a ver si tal).
Comprueba por otra parte los plugins que tengas instalados para el explorer. Vete aquí:
http://www.nirsoft.net/utils/shexview.html y descárgate el programa ShellExView para tu versión de windows (x86 o x64). Ordena las extensiones por fabricante, excluye las que sean de Microsoft y vete deshabilitando las que te parezcan sospechosas. No te olvides de reiniciar cuando lo hagas. Esto no va a ha hacer que te deje de funcionar el explorer, sólo te deshabilitará funciones que tengas instaladas, como accesos en el menú del botón derecho y cosas así.
En última instancia, prueba a restaurar los archivos del sistema ejecutando SFC /SCANNOW .
PD: Le has dado al Process Explorer para que te muestre todos los procesos, ¿no?.