A mi me pasa algo parecido desde que cambié de procesador. De un Athlon II X2 4400e a un Phenom II X4 965.
Estoy con cualquier juego y de repente el framerate baja a 10 fps unos segundos y luego se recupera. No sé en qué irá el problema. No es por calor en el micro ni por el disco duro, porque no parpadea la luz del HD cuando lo hace.