Bale, lo siento resulta que el router estaba configurado como gateway, ya que tiene la opción de configurarlo como gateway y como router, por eso se veian uno con el otro i tenia internet, el router solo actuaba de switch, (lo veia raro que se pudieran ver los dos pero para no complicarlo mas lo puse que si que ).
Ahora el problema és el siguiente, con esta configuración como hago para que el segundo departamento tenga internet, proporcionado por el router del primer departamento pero siguiendo estando cada departamento en redes diferentes!
En el momento que le doy la opción de que actue como router ya no se ven las carpetas compartidas obviamente porque estan en dos redes diferentes pero deja de tener acceso a internet el segundo departamento.
Como lo hago?