Seguramente sea la placa que no reconoce más de un determinado número de gigas, en algunos discos de Seagate además del Master, Slave, Cable Select y Unique, tenia una tercera opción en el jumper que era para compatibilidad con sistemas antiguos que lo único que hace es limitar el número de gigas del disco para que sea reconocido por la bios.
De todas formas prueba entrar en la bios y hacer un Scan de los IDEs a ver si te detecta ahí las particiones.
Si eres más atrevido puedes actualizar la bios de la placa, pero te aviso que es algo complicado, sobre todo en placas no muy modernas, además de que podría quedar inservible la placa si por ejemplo se va la luz durante el proceso de actualización.
Otra cosa que puedes mirar es el formato de las particiones FAT16, FAT32, NTFS, Linux Native,... Destacar que FAT16 no trabaja con disco de más de unos determinados GB (no recuerdo cuantos exactamente).
Un saludo!
