si tienes el pc y la ps3 en red puedes ver los subtitulos del mkv usando el ps3 media server que hace las reconversiones él solito. en el foro de Scene hay un post sobre él.
para reconvertir ficheros puedes usar el mkv2vob o el ts2muxer, hay diferentes opciones para incluso hacerlo un AVC-DVD o AVC-HD y asi poder activar los subs, quitarlos, cambiarlos, cambiar idioma... ete ce...
mira tambien sobre el programa multiavchd.
si en el titulo pones algo referente a la duda, sera mas facil que gente con tu misma duda encuentre esto despues
