Podria ser que te este bajando partes corruptas y por eso luego, vuelve a su estado anterior... a mi me a pasado algunas veces, no tan exagerado como a ti, pero es una posibilidad.
Otra cosa que se me ocurre, tienes suficiente espacio en el hd?
De todas formas, en los logs tendria que salirte el porque esta pasando eso.
