Datos? archivos? o programas instalados y demas?
Para pasar los datos conecta el HD y listo, pasalos donde kieras guardarlos para no perderlos cuando formateas.
Lo ideal es q tengas aunq sea 2 particiones, asi puedes guardar los archivos importantes en la 2ª particion y no tener q andar con estos "liso" cuando haz de formatear.