La nueva version del pciexpress aumenta sus prestaciones pero no tiene porque notarse mucho.
Por ejemplo en los discos duros mecanicos la mejora entre sata2 y sata3 practicamento no se notaba porque muchos discos tienen una velocidad de transferencia inferior a los 150 mb/s que es el máximo no ya de sata2 sino de sata1, en los ssd por contra si, pero enttre un ssd sata en sata3 y un ssd en m2 la diferencia tambien depende del modelo porque hay ssd que no dan más de 600 mb/s que es el máximo de sata3.
Te lo explico con los discos porque con las tarjetas gráficas no se bien como son los datos pero es algo parecido muchas gráficas la diferencia entre pci-e 2.0 y 3.0 son inapreciables, a veces solo con test y programas que cuentan los fps es como lo puedes ver.