¿Bastante parejas? Una placa vale 240€ (la MSI), es gama de entrada para el socket grande como quien dice, la Asus sale por 400€, algo de diferencia tendrán, ¿no?
La mayor diferencia son los extras, la Asus viene bastante más cargadita: Tarjeta de red AC 3x3, mejor sistema de sonido (chip realtek pero con condensadores buenos y bien aislado), soporte para quad-sli/cf (la MSI "solo" soporta 3-way), mejores fases, pantalla de diagnóstico, botones en PCB, tarjeta pcie de control de ventiladores, dos tarjetas de red...
La MSI solo tiene el USB3.1 como baza a su favor.
También depende de cuántas de esas cosas te importen y cuánto puedas sacar vendiendo la que sobra. También me gusta más el soporte en cuanto a actualizaciones de BIOS de Asus, pero por goleada. Si el USB3.1 es vital siempre le puedes poner una controladora pcie, pero yo ni me molestaría.
Saludos