Después de andar comprobando cables y demás conectores, creo que no le pasa nada.
Me fije en dos cosas:
-Con el ordenador apagado, me fije que cuando apagaba a F.A (dandole a un interruptor que tiene la misma) veia que, al volver a encender ese interruptor, y darle al power de pc, volvia hacer eso de funcionar todo, parar y volver, pero en el tiempo en el que se paraba todo, la F.A seguía funcionando con normalidad, ya que los ventiladores de la F.A seguían funcionando.
-Probé hacer lo anterior pero sin apagar el interruptor de la F.A y al darle al power se encendió todo sin pausa alguna, vamos, lo normal.
No creo que haya problema, pero sigo abierto a opiniones.
Pd: El ordenador cuando para, no se reinicia, solo paran los ventiladores un instante, lo se porque se oye el disco duro o la unidad lecora.