Lo de la codificación será problema del MoreTV. Mira a ver cuántas lineas de test. Cuántas más pueda soportar tu procesador, mejro descodificará. Si tienes un procesador normal de los de hoy en día, podrás perfectametne poner 99 que es el máximo.
También, existe un programa llamado MoreTVSound, que aunque su nombre no coincide del todo, lo que hace es meter en el MoreTV lo mejores valores de configuración para tu tarjeta de TV.
Espero que con esas dos cosas te solucione algo, aunque a pesar de todo, es inevitable que haga algún parpadeo codificado de vez en cuando.
Un saludo.