@ignition , te mande un MP pero te lo dejo también por aquí.
El truco es ajustar con paciencia cinco parámetros en el
OSSC :
- Analog sync Vth
- Hsync tolerance
- Vsync threshold
- H-PPL Prec-Coast
- H-PLL Post-Coast
Te dejo mi configuración con la que la imagen de la Neo Geo queda completamente estable :

Espero que te sirva.
La configuración de la Super Famicom en mi caso es la misma de la Super Nintendo, nunca he tenido problema con esta consola, aún así mañana te digo los valores de esos parámetros.
Dicho esto, yo uso un monitor de PC (4K en mi caso y se ve alucinante) que son más compatibles a las perrerías de señal del
OSSC, las teles no dan tanto juego, al menos con las que he probado.
También recuerdo que cuando no veía nada en el monitor el
OSSC indicaba que no detectaba señal, yo tenía ahí el problema pero igual en tu caso el problema lo tienes en la tele o monitor que usas que no es capaz de pillar la señal particular del
OSSC y en ese caso tendrás que tunearla hasta que la pille.