En teoría no importa la version del PCIe, la grafica se adapta.
En la practica, algunas placas viejas pueden no detectar graficas nuevas, pero esto es algo que no puedes saber hasta probar. Googleando un poco, se ven algunos que compraron de las ultimas graficas con placas de la misma familia que la tuya, asi que espero que no tengas problemas.
Saphire radeon HD 2gb o de un 1gb
eso no es ninguna tarjeta, tienes que decir el numero, con eso solo dices el ensamblador y la cantidad de memoria que tiene, no estas diciendo lo mas importante, que es el chip grafico y el tipo de memoria.
Por otro lado, tambien tiene cierta importancia que fuente de alimentacion tienes.