Ejecuta el Regedit, y vete hasta la siguiente cadena:
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\windows\CurrentVersion\Unreadmail
Allí te aparecerá una lista de todas las cuentas que usan el messenger, si entras en cada una verás que a la derecha te aparecen varios valores, edita "MessageCount" y pon el valor 0.
Cuando hayas puesto todos a cero,
menos el tuyo, pincha en la carpeta "UNREADMAIL" y encima con el botón derecho del ratón le das a exportar y guardas la cadena del registro y le pones "Borrar Mensajes" o "Poner a cero" o lo que quieras.Guardala en un sitio que te acuerdes
Cada vez que ejecutes esta cadena de registro, te advertira que si estas seguro que quieres agregar la cadena al registro, le dices que si y aceptas. Con esto habrás reseteado el contador de mensajes por leer de todas las cuentas, excepto de la tuya.
Captura explicativa:
