Mira que no tengas algún virus, y luego, ¿cuando instalas el driver, lo instalas encima, o lo desinstalas primero y luego lo instalas?
Prueba el ratón y el teclado en otro PC si puedes también, así salimos de dudas.
Aunque realmente tiene pinta de que se te apaguen los USB, o que no se activen hasta que detecten algo conectado, y parece ser que no te lo detecta hasta que lo conectas una vez encendido el SO, no si está conectado de antes.
Salu2!