Evidentemente puedes poner la 9800GT para físicas en los pocos juegos que lo utilizan y mejorará el rendimiento de la GTX560 sola... Tampoco me preocuparia mucho de temperaturas y consumo, puesto que si tienes una caja decente, las green precisamente tienen esa ventaja/caracterísitica (consumen poco y no son muy calentonas). Además para físicas no te subirán demasiado las temperaturas...
Saludos,