Si utilizas el firefox hay un plugin muy bueno que te sincroniza los marcadores online, el plugin se llama Xmarks y va de lujo. Si formateas una vez vuelves a instalar el firefox instalas este plugin sincronizas con el servidor y voila, tus favoritos como antes, incluso te da la opción de sincronizar las contraseñas!!!!
Hay otro plugin que creo que se llama FEBE que te hace una copia de todo lo que tienes en el firefox y luego sólo necesitas restaurar esa copia
