Puede que sólo estén deshabilitados, búscalos y compruébalo:
Clic derecho en MI PC > propiedades y en la pesataña Hardware, pincha en Administrador de dispositivos.
En la lista que sale, aparecerán todos los puertos USB, si están deshabilitados puedes habilitarlos de nuevo y cuando acabes volver a dejarlos como al principio.
Suerte.