Hola, voy a intentar resolver tus dudas pero hay gente por el foro que domina bastante mas del tema.
1- A la placa se le da alimentación 12 y 5 v, se le saca señal de Video y los controles de los mandos para 2 jugadores.
Normalmente se usa un conector JAMMA, aunque se puede soldar directamente en la placa (Valido pero no recomendable)
2- Normalmente se le saca RGB, pero es posible sacar otras señales mediante conversores.
3-Los mandos puedes adaptarlos tú, o crearte un stick si compras palancas y botones, el único requisito es que acaben en un conector DB15 hembra.
Ya que de la placa sacas los controles y los conectas a un DB15 macho.
También puedes conexionar con DB9 y te servirian los mandos de megadrive.
4- Las placas varian en tamaño, en número de cartuchos, hay algunas que ya tienen los conectores DB15 integrado en la placa.
Las más cómodas son las pequeñas tipo MV-1A, o MV-1B.
Aquí tienes mas info:
http://www.briconsola.com/esp/neos.htm 