El procesado por GPU complementa al de CPU. Y sí, necesitas unos drivers en concreto que es posible que no tengas. Hace unos meses yo tuve que utilizar CUDA en mi tarjeta (8600 GTS) y tuve que bajarme una beta de los ForceWare porque la última versión estable no los tenía.
Había un pequeño programa que te hacía un test y valía para comprobar si lo tenías activado, pero ahora no consigo encontrarlo.
No sé qué SO usas, pero si usas XP, por ejemplo tienes
esta versión, que es reciente, y dice "Supports CUDA", así que esta te valdría.
Edit: ya se me adelantaron, pero bueno, ahí queda eso

Edit 2: de todas formas estoy viendo que TMPGEnc sólo usa CUDA para aplicar filtros y decodificar vídeo MPEG. Todavía no se usa para la codificación de vídeo (lo dice
aquí), que es lo que más tira, así que lo más seguro es que no notes ninguna diferencia de rendimiento, a no ser que pongas toneladas de filtros

De hecho, en una codificación sin apenas filtros va más lento...