Uno de los problemas principales del ruido de los ventiladores no son ellos en si mismo, si no la velocidad a los que los haces trabajar.
Con un rehobus, o regulándolos para que no soplen siempre al 100% notaras una bajada de ruido considerable.
Como no especificas mucho que configuración tienes, ni cuantos ventiladores, ni como los tienes conectados, no sabría especificar mas. Cuantos ventiladores y como y donde los tienes conectados?
A parte, la fuente, lo importante es que esa fuente tenga un carril de 12v para esa gráfica, si no lo tiene, posiblemente cuando juegues y exija la gráfica mas carga se quede tiritando la pobre y puede que te de algún susto, miratelo.