Cierto, totalmente, interpreté que la consulta era relativa a la compatibilidad DVI-HDMI.
Respecto al rendimiento, nunca lo he comprobado, pero imagino que para no impactar en el rendimiento, el modo de duplicación de pantalla es el más eficiente, mientras que la extensión de escritorio puede tener un cierto impacto, porque el framebuffer tiene un tamaño efectivo superior (del doble en tu caso).
Saludos.