Recorta/divide el clip de video
Supongo que tendras dos tracks de clip de video [en un track el video de ustedes y el otro track con el video del amigo en el chat], podras dividir el chip del chat para quitar los 3 segundos, usas la herramienta de tijeras [scissors tool o razor tool], retiras el pedazo y unes los otros dos quedando en una sola secuencia.
Aqui se ve un track con un video cortado [dividido] en tres partes.
Cortas el click para crear 3 bloques y quitas el de los tres segundos
Aqui un esquema de cortar el clip de video, quitar el tramo que no queremos y 'arrastrar' el tramo final para unirse al primero.
Clip con dos cortes, quedando tres tramos
Desechamos el segundo tramo y juntamos los dos restantes
Ahora, tu deberias tener dos tracks de video en la linea de tiempo, ejemplo, aqui vemos tres tracks: Dos de video y uno de audio.
Seria poner el clip del chat en uno de los tracks y poner en el otro track el video de ustedes y ajustar como se ve la imagen.
https://www.youtube.com/watch?v=ib8RBPsM4lI 