Buenas !!
Por mi experiencia, por lo menos con las placas que he montado (Asus), si la gráfica la montas en el PCI-e que no corresponde, se te enciende una lucecita en la placa (color rojo), y no hace nada, esta esperando que le pinches la Otra y que le metas chicha en la placa base, (conector de alimentación de toda la vida), aparte las asus por lo menos tienen una tarjetatilla para indicarle a la placa si va a tener una o dos gráficas (Single o dual). por lo que si le pones dual pues espera otra gráfica en el otro slot, y si le pones single pues el otro slot se queda sin chicha.
Bueno no se si he aclarado algo o lo he liado o me he liado yo, pero si alguno tiene más datos que los exponga a ver si lo aclara mejor.
saludos