Una cosa es el USO y otra la ACTIVIDAD, pero por lo que dices suena a que es un cuello de botella o bien en el procesador o bien en la RAM (insuficiente), (que haya visto) es en los únicos casos en los que el frame rate pega esos tirones. A menos que el juego sea una kk en programación xD.
A un amigo le paso y tras mirar no logro nada y eso que tiene un SSD. Al final lo ignoro por completo y el problema desapareció por si solo. (Windows ¯\_⊚⊥⊚_/¯ ).
No creo que el uso de HDD/SSD alto produzca tirones sino más bien tiempos de carga mayores afectando algo al frame rate de forma constante y continua.
Tal vez si dieras información del HW podríamos saber de donde viene el problema exactamente o hacernos una idea y así poder ayudarte mejor.