Para nada afecta al funcionamiento, no le estas diciendo que funcione a 200, solo que el mínimo sea ese, te puedo asegurar que aveces le doy sesiones de 10 o mas horas de juego con un Noctua NH-U12S con doble ventilador y funciona todo como un tiro con un 4790k, es mas, como esto me pasaba cuando hacia bastante frió llegue a la conclusión, mía por supuesto, que el ventilador al estar configurado a un mínimo de 300 no llegaba a esas vueltas mínimas debido a la temperatura ambiente por lo que daba ese error, fue bajarlo a 200 y jamas volvió a pasar.
Igual no es tu solución pero por probar no va a pasar nada, pero parece que es lo mismo que me pasaba a mi y con una placa similar.
Edit: AlvgarD tiene razón lo tienes conectado a una toma de ventilador de chasis, conectalo al CPU FAN.
. Busca que tiene que haber algún apartado que ponga algo como "CPU fan warning" o como lo hayan traducido y lo desactivas. 