Acronis Back and Recovery 2011 y 2012 tienen una opción de copia continua que hace un respaldo cada 5 minutos sólo de lo que has modificado, creo que es lo que más te conviene. También tienes el Syncback, que tiene una versión gratuita, pero es más lioso de configurar (tendrías que hacerte un script como dice el compañero para que te hiciera la copia al apagar).
