convertir disco externo en interno.

Si tu placa no admite discos de mas de 60gb, no es posible, no tiene que ver con particiones. sino con disco fisico.
Otra cosa es que en la web del fabricante, haya un parche para la BIOS que te sirva.

Mmm... a ver si lo entiendo.

Tienes una placa que no te soporta los discos de mas de 60? no?. Pero estos seran Discos ide internos.

Si como has dicho te has comprado un externo [que ira por USB supongo] la pregunta seria ¿tu placa soporta arranque por USB?.

Si es asi, no tienes problemas para tener el disco duro externo dentro de la misma carcasa. Incluso lo peudes preparar para coenctarlo directamente a la placa y ocultar el transformador.