Que caja tienes? Trae regulador para los los ventiladores?
Si no trae tienes 2 opciones, comprar un controlador de ventiladores que el mas barato cuesta sobre 17€ o cambiar los ventiladores por versiones PWM que se pueden controlar por software (Tanto desde la Bios, Speedfan y la mayoria de fabricantes tienen software especifico para esta función en Windows).
Los ventiladores que no son PWM al conectarlos se ponen a girar al máximo de RPM independientemente de lo que estés haciendo, con un regulador cambia el voltaje y permite hacerlos girar en varios rangos de potencia (Pero vas a tener que estar cambiandolo tu siempre)
Los PWM tu le indicas que temperaturas y rango de RPM quieres tener, a partir de ahi y dependiendo de la calidad de estos y tu placa base se ajustaran automáticamente a tus necesidades.
Pero ojo en tener una buena circulación de aire o tendras mas ruido del necesario.
Piensa que el aire caliente es ascendente por lo que el aire frió siempre debe de entrar desde lo mas bajo posible y salir por la zona mas alta para así tener un caudal limpio.