Conexion a internet con consola modificada?

Hola,

Hace poco flasheé mi Switch con Atmosphere siguiendo un tuto de CFW de Nintricks.

Tengo el firm 10.1.0. Llevo como un mes jugando a backups dentro del atmosphere, y he arrancado el SO original, con ambos desconectados de internet.
Tengo comprados bastantes juegos originales tanto en físico como en digital.
Mi pregunta es la siguiente:
¿Puedo conectarme a internet normalmente desde el SO original y bajarme mis juegos digitales de la eshop?
Atmosphere no lo he conectado ni lo voy a conectar a internet. Modo avión forever. Pero no sé si hacerlo arrancando el el SO original me baneará la consola.

Una cosa, los archivos de los juegos los tengo en una SD propia para los juegos originales, y por otro lado tengo otra SD independiente con los archivos del flasheo y los juegos backups.
Lo que pienso es que los savegames sí que estarán en la memoria interna de la consola....

Gracias de antemano,
@trunkschavi si has hecho emmunand y tienes la nand limpia si que podrías conectarte online desde OFW
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