Por si alguien se había interesado por el tema, traigo buenas noticias

Probé el Rescuetime durante una semana, pero resultó no ser lo que necesitaba. Se basa mucho en la productividad de las tareas que estás haciendo ("Muy productiva" o que "distrae mucho la atención"), añadiendo ratios de productividad por todos lados, más que en decirte qué programas utilizabas, a qué horas y qué hacías en cada programa.
Hace poco encontré el programa que necesitaba
vía freewaregenius. El programa se llama
ManicTime, y hace exactamente lo que necesitaba.
Este programa te dice a qué hora abres cada programa, el porcentaje de uso con respecto a los demás programas, qué archivo estabas viendo con dicho programa, qué página web estabas navegando, incluso a qué hora has estado fuera del ordenador. También existe una opción "Go off the record" para que no "vea" nada de lo que estás haciendo
Por si a alguien le interesa el tema de la productividad al PC y quiere controlarse pasivamente, éste es su programa.