En windows lo puedes hacer seleccionando todos los archivos que quieras renombrar. Luego le das a F2 y te dejará renombrar el primero de ellos. Una vez le hayas cambiado de nombre, al pulsar enter te cambia el nombre de todos los archivos a la vez, diferenciandose en un subíndice (1), (2), ...
Espero que esto te sea de utilidad.
Saludos.