Buenos días,
Entiendo que el disco duro SATA lo tienes como "auxiliar" es decir, que tienes otro HD con el S.O.
Yo en tu lugar, cogeria los datos importantes y los pasaria a un CD o DVD (dependiendo del tamaño) y como bien ha dicho PASODETOD, formateas siguiendo las instrucciones.
1 paso, particionas (especificas el tamaño de la particion)
2 formateas (es decir seleccionas el formato, FAT32, NTFS...)
Un saludo y suerte.