mas q codigo html sera codigo php , y el contador puede apuntar a un fichero de texto q seria lo facil , o puede apuntar a una bbdd... todo depende de lo q kieras... tb puedes usar con codigo de google analystics y basarte en eso , segun lo que quieras y para que lo quieras xD.
Normalmente este codigo se pone en algun include del sistema , es decir en una pagina que se repita en todo el sistema , aunq de este modo si una misma persona visita 10 links , tendras 10 visitas. Lo mejor seria en el index ...