A ver, si realmente es problema de sistema operativo, en el proceso de arranque del equipo SÍ debería leerte la unidad de cd-dvd.
Sino lo hiciera, pues no vas a poder formatear e instalar (si es xp o linux, puedes hacer todo en el mismo proceso, no tienes que formatear primero por tu cuenta). Pero si no lo hiciera, tienes algo cascado físicamente xD