A la hora de descomprimirlo te ponia que mandases una clave, despues de esto te salieron los archivos, que segun dices eran para clonecd. Si es asi tiene que tener tres archivos con extensiones CCD, SUB e IMG.
Si es asi lo unico que tienes que hacer es abrir el clone, seleccionar grabar imagen, seleccionar donde tienes estos archivos, marcar el que tiene extension CCD y grabar.
Yo tengo esa misma version y me va de maravilla. Si te crea posavasos puede ser que lo que te bajaste este corrupto, porque sino no veo la razon. Prueba ha hacer la copia con el alcohol 120%.
La velocidad recomendable es 4x, y si el juego esta bien, tiene que estar en modo 2, por lo que no tienes que marcar nada, ya que el propio clone te lo grabara asi.
Suerte.