Efectivamente, solicitas un código en la web de la Fábrica de Moneda y Timbre y con ese código vas a una oficina para verificar tu identidad, después vuelves a meter el código en el mismo ordenador donde lo solicitaste y ya lo tienes.
Con el DNI electrónico creo q no necesitas ir a la oficina, pero claro teniéndolo tampoco es muy necesario el certificado (aunque es mas cómodo q estar trasteando con el DNI).
Salu2