Buenas, si la tarjeta a perdido el formato me parece que sólo queda intentar recuperar todos los datos posibles y luego formatearla, estoy practicamente seguro de que no hay otra alternativa.
Como programas a utilizar; Windows Data Recovery o "GetDataBack -Edicion FAT-", pero no sé si son los más adecuados, de todas formas probaría primero Windows Data Recovery.
Es muy importante no leer continuamente la tarjeta en vano, porque cada vez que un programa acceda a la información, ésta se deteriorará más.