Puedes buscar un cable en una tienda de electrónica o en una tienda de informática mas especializada.
Por otro lado, ese conector de la placa base, no me suena que sea para USB.
Exacto, ese puede no ser el conector usb interno. El conector son dos filas, una de 5 pines, y otra de 4 pines arriba o abajo, segun se mire, el quinto pin de arriba no tiene conexion, simplemente es para orientar el cable y no ponerlo al reves. El conector de la placa que pones mas bien parece de firewire.
Pero tampoco te puedes fiar, tambien puede que lo sea, ahora que lo pienso, si el conector no te vino con la placa, la configuracion de pines puede ser diferente, no hay un estandar, que modelo de placa es?