Para que te hagas una idea visual de una caja en la que cabe justa la 4850, te pongo mi equipo:
hilo_postead-aqui-vuestros-equipos-2_986657_s170#p1717036426Ni idea de cómo es por dentro la caja (tampoco google tiene idea

), pero si pones los discos duros en las unidades de 5 1/2" y puedes remover como en mi thermaltake armor jr la bandeja de los discos duros, entonces no deberías de tener mucho problema. La otra opción es hacer bricomanía

Uno de mis planes a corto plazo es dejar este Pc overclockeado un poquillo sólo para jugar, con lo que los HDDs de almacenamiento de 500 y 1Tb los movería a un HTPC (que ya tengo configurado), el velocirraptor lo movería a una de las bahías de 5 1/2" suspendido por gomas probablemente, donde ahora mismo tengo la DvD-RW que moveré al HTPC.
Las medidas que dices, tengo una Asus 4850 1gb, y son 23cm de largo por 2 bahías de alto por casi 10cm de ancho. El conector PCI-E es unos 2cm como dices
Espero haberte servido de ayuda