El Adblock más bien es para banners molestos que estén incrustados en una misma web (ya sea en gif o en flash, aunque no todos los flash deja bloquearlos =/).
Para ventanas emergentes usa el NoScript que te han dicho. Cuando estes en la web dónde aparezcan esas ventanas le das al botón de "NoScript" que tendrás en la parte abajo-derecha del Firefox y añade a toda dirección sospechosa al filtro.
