Pues supongo que porque en contabilidad es A la contabilidad "oficial" y B la oculta, y esto guarda similitudes con ser la "cara A y la cara B de la moneda", en la que vemos una parte y queda escondida la otra, igual que en el caso de la economía sumergida, o de un disco con cara A y cara B, y porque la denominación de caras A y B es en general muy común, siendo la A la que se ve y la B la que queda debajo. Es decir, que queda muy metafórica la cosa y encaja con el lenguaje y asociación de ideas común. (P.D.: Ni zorra de si es así, opinión 100%).