Pues con un programa de grabacion de sonido, desde algo tan basico como la Grabadora de sonidos de Windows (si usas Windows claro), hasta software mas complejo como Cool Edit o Gold Wave, por decir alguno (hay uno q es soft libre, bastante popular pero no recuerdo el nombre).
Con estos programas grabas lo q sea desde la fuente de sonido q te configurada en la tarjeta de sonido como fuente activa de grabacion (desde el control de volumen, line in suele estar activo por defecto pero igual no, y entonces te grabaria un bonito silencio

)
Con un programa de estos, tradicionalmente graba en WAV, formato de sonido digital puro sin comprimir (en principio, aunq puede ser un WAV ADPCM q es comprimido). Depende del soft q tengas, pues puede guardar directamente en MP3 aquello q hayas grabado.
De todas maneras, si es musica normal q no sea dificil de conseguir, yo de ti bajaria los correspondientes MP3, tendras mas calidad.
Saludos!