Primero edita el archivo de arranque para borrar del inicio el sistema a arrancar. Como te saldran 2 windows, para saber cual es cada uno edita el nombre a por ejemplo windows 1 y windows 2:
Boton derecho sobre mi pc-propiedades-opciones avanzadas-inicio y recuperacion(configuracion)-editar
Te saldran las 2 lineas de arranque de tus windows. Modificales el nombre para que sean reconocibles, en prinicpio la buena es la primera y salva los cambios.
Reinicia y arranca con la primera. Si esa es la sesion que quieres conservar pues bien. Haces lo mismo que antes, edias el nombre por el bueno que quieras dejarle ahora y borras la otra linea completa del otro arranque de windows y salvas los cambios
Ahora desde windows borras la particion(boton derecho formatear) la particion donde estaba tu otro guindous y listo. Ahora si quieres "juntar" las particiones puedes hacerlo con partition magic o similar, busca en softonic. Espero haberte servido de ayuda. Un saludo