Los discos duros SATA no los detecta windows directamente y muchas bios tampoco, con el cd de la placa tienes q hacerte un disquete con los drivers si vas a instalar desde cero el S.O y pulsar F6 al comienzo de la instalacion para que luego te pida controladores para el, durante el proceso de instalacion. Si ya tienes S.O instalado comprueba q tengas los controladores Sata correctamente instalados.
De todas formas, ese clac--clac que comentas da muy mala espina pues puede deberse a un fallo hardware del propio disco.
Espero que te sirva.